Ich weiß nicht, ob es ein Problem ist. Für mich ist IMAP die einfachste Variante. Mein Thunderbird ist so eingestellt, dass er sich immer lokale Kopien meiner Mails anlegt.
Ich kenne dein Setup nicht, weiß nicht, wie viele Accounts du bei wie vielen Anbietern hast und ob du dort nur begrenzten Speicherplatz hast.