Misskeyはそこまで大きくない規模の鯖にNewRelic APMとかを噛ませてみるといいと思う。Node.jsのAPMも結構ちゃんと出してくれるし、100GBまでは無料枠がある。ioでやると1000万くらい掛かると思うので絶対やれないけど。