『連合なし』は、投稿を同じサーバのユーザーにしか見られないようにするもので、あなたの投稿を読みたくてあなたをフォローしているフォロワーのうち、リモートサーバにいるフォロワーを無視する設定です。
投稿のURLがわかっていれば誰でも見られます。
『フォロワー』は、サーバーの内外を問わず、自分のフォロワーのみに公開する設定です。
投稿のURLがわかっていても、フォロワーでなければ見られません。
どちらも、公開範囲を限定することで得られるメリットのために使うものですが、正反対の性質を持っているので、上手に使い分けてください。
※ 『連合なし』をサポートしているMisskeyの話です