現代国際法で語るなら……。
琉球王国は，独自の政治体制（国王の下にある王制）と領土と統治民を持つ独立国であったわけで，それに対し武力で征服したのが明治日本政府だったわけで，ここだけ見るとイランのクウェート併合となんら変わるところはないわけです。
（とはいえ，当時の清との関係を現代国際法で語っていいかという問題はあるんだけど。少なくともヨーロッパ国際法を適用すれば独立国家であることは争えないと思う。）

で，ここから先は，国際法の話から離れるけど，そんな沖縄県に対し，第２次世界大戦時には地上戦の舞台とし，日本返還後も米軍基地負担を本土より多く課しておきながら「日本としてのアイデンティティ」を求めること自体，「ちょ，待てよ～」と木村拓哉っぽく言ってみたい感じはする。
（いい？イランのクウェート併合と同じレベルよ。）